我國(guó)科學(xué)家公布藏羚染色體水平高質(zhì)量基因組

記者近日從中國(guó)科學(xué)院西北高原生物研究所獲悉，該研究所研究員張同作聯(lián)合青海大學(xué)副教授魏青等團(tuán)隊(duì)，成功組裝藏羚染色體級(jí)別的基因組，獲得藏羚染色體水平的高質(zhì)量基因組和注釋信息。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《自然》旗下綜合性科學(xué)期刊《科學(xué)數(shù)據(jù)》上。

藏羚是國(guó)家一級(jí)保護(hù)動(dòng)物，主要分布在青海可可西里、西藏羌塘、新疆阿爾金山等自然保護(hù)區(qū)，在維持青藏高原生態(tài)系統(tǒng)平衡中具有重要作用，是研究高海拔適應(yīng)性機(jī)制和遷徙行為的良好模型。但目前公開數(shù)據(jù)庫(kù)中仍缺少藏羚高質(zhì)量的染色體水平基因組，嚴(yán)重限制了基于遺傳特征解析其物種適應(yīng)、進(jìn)化及種群生態(tài)相關(guān)工作的開展。

這是藏羚基因組的組裝和注釋結(jié)果。（受訪單位供圖）

通過多種測(cè)序技術(shù)，研究團(tuán)隊(duì)成功組裝了藏羚染色體級(jí)別的基因組。張同作表示，數(shù)據(jù)評(píng)估表明組裝的連續(xù)性好，完整度和準(zhǔn)確性高；藏羚基因組中重復(fù)序列注釋結(jié)果表明，藏羚基因組重復(fù)序列總長(zhǎng)度為1.65GB，占基因組的52.47%，同時(shí)在藏羚基因組上共注釋到28330個(gè)功能基因。

張同作介紹，此次成功組裝藏羚染色體級(jí)別的基因組，將為藏羚的適應(yīng)進(jìn)化遺傳機(jī)制、保護(hù)遺傳學(xué)研究及進(jìn)一步探索物種遷徙行為的遺傳機(jī)制提供重要基因組資源。（記者陳杰）

來(lái)源： 新華社