基因療法新拼圖：算法揭示188種新型CRISPR系統(tǒng)

基因療法新拼圖：算法揭示188種新型CRISPR系統(tǒng)

IT之家 11 月 25 日消息，科學家近日開發(fā)出新算法，在數(shù)十億個蛋白質(zhì)序列中，成功發(fā)現(xiàn) 188 個罕見且以前未知的 CRISPR 連接基因模塊，為利用 CRISPR 系統(tǒng)和了解微生物蛋白質(zhì)的功能多樣性提供了新見解。

圖源：Carlos Clarivan / Science Photo Library

該項目由 CRISPR 技術先驅(qū)張鋒教授帶領，團隊成員來自麻省理工學院麥戈文腦研究所、麻省理工學院和哈佛大學布羅德研究所以及美國國立衛(wèi)生研究院國家生物技術信息中心（NCBI）等，相關成果于 11 月 23 日發(fā)表在《Science》期刊上。

團隊開發(fā)出新的搜索算法基于快速局部敏感哈希聚類算法（FLSHclust），使用該算法深入挖掘三個主要的公共數(shù)據(jù)庫，從中識別出了 188 種新型 CRISPR 系統(tǒng)，并對其中 4 個系統(tǒng)進行了詳細表征。

這些新系統(tǒng)可能被用來編輯哺乳動物細胞，其脫靶效應比目前的 CRISPRCas9 系統(tǒng)要少，也有可能在被用于診斷或用來記錄細胞內(nèi)部活動。

該研究發(fā)現(xiàn)了幾種已知 I 型 CRISPR 系統(tǒng)的新變體，未來能被用于開發(fā)更精準的基因編輯技術。

此外，研究人員還發(fā)現(xiàn)了一些 IV 型 CRISPR 系統(tǒng)的新的作用機制，以及精確靶向 RNA 的 VII 型系統(tǒng)（有可能被用于 RNA 編輯）。研究人員表示，該研究突出了 CRISPR 系統(tǒng)前所未有的多樣性和靈活性。

IT之家附上論文參考地址：Han AltaeTran et al.,Uncovering the functional persity of rare CRISPRCas systems with deep terascale clustering.Science382,eadi1910(2023).DOI:10.1126/science.adi1910